桑蠶基因組研究再登《科學》

        北京時間2009年8月28日凌晨兩點，由深圳華大基因研究院與西南大學合作的研究成果“40個基因組的重測序揭示了蠶的馴化事件及馴化相關(guān)基因”在國際著名學術(shù)雜志《SCIENCE》（《科學》）上發(fā)表，這是兩家單位自2003年以來在家蠶基因組研究領(lǐng)域取得的又一項重要成果。
        據(jù)悉，本研究共獲得了40個家蠶突變品系和中國野桑蠶的全基因組序列，是多細胞真核生物大規(guī)模重測序研究的首次報道，共獲得632.5億對堿基序列（63.25Gb），覆蓋了99.8％的基因組區(qū)域；繪制完成了世界上第一張基因組水平上的蠶類單堿基遺傳變異圖譜，是世界上首次報道的昆蟲基因組變異圖；從全基因組水平上揭示了家蠶的起源進化；發(fā)現(xiàn)了馴化對家蠶生物學影響的基因組印記。

        桑蠶大規(guī)模基因組重測序和遺傳變異圖譜構(gòu)建的完成，有助于從全基因組范圍研究馴化和人工選擇對家蠶生物學的影響，闡釋家蠶及野桑蠶之間生物學差異的遺傳基礎(chǔ)。更為重要的是，鑒于與野桑蠶相比，家蠶具有更優(yōu)良的經(jīng)濟性狀，本研究所發(fā)現(xiàn)的全基因組選擇印記，特別是那些受到強烈選擇的具體基因，對家蠶重要優(yōu)勢經(jīng)濟性狀相關(guān)基因克隆及其形成機理的研究至關(guān)重要。
        據(jù)專家介紹，本次合作昭示了一種全新的模式：珍貴的種質(zhì)資源、一流的技術(shù)平臺以及海量數(shù)據(jù)的科學分析緊密結(jié)合，顯示出基因組科學的巨大生命力。
        西南大學蠶學與基因組學重點實驗室經(jīng)過16年的積淀，積累了寶貴的桑蠶種質(zhì)資源，本次研究的40個代表性的家蠶和中國野桑蠶品系全部來自于該單位。
        深圳華大基因研究院擁有亞洲第一，世界前三的新一代基因組測序平臺，日產(chǎn)數(shù)百億堿基，成功實施了“炎黃一號”、“國際大熊貓基因組計劃”等多項大型基因組計劃。在不到兩個月時間里，研究團隊即完成了該項目的全部實驗和測序工作。海量數(shù)據(jù)產(chǎn)出之后，深圳華大基因研究院自主搭建的超算中心及自主開發(fā)的生物信息軟件發(fā)揮了重要的作用，利用超大規(guī)模計算能力，研究團隊完成了龐大的數(shù)據(jù)處理，迅速完成了數(shù)據(jù)分析和成果發(fā)表。
        該資源積累與技術(shù)平臺、信息分析強強聯(lián)合的創(chuàng)新研究模式，必將拓展到其它物種的研究，成為基因組學普遍的研究模式。團隊負責人表示，該計劃后續(xù)所有的目標，都將集中在“發(fā)現(xiàn)基因、研究基因和利用基因”這三個重點上，利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)制作的新型蠶品種和相關(guān)產(chǎn)品，將于近期進入人們的視野。